南京市中西医结合医院病理科经过二十多年的发展，科室目前现拥有DVP-W3600高清晰度病理图文分析诊断系统，CX-41奥林巴斯显微镜，高精度TSJ-Q型全自动封闭式组织脱水机， Leica RM2126轮转式切片机，LT—YJ2000自动液基薄层细胞涂片机，BMJ-Ⅲ型半自动石蜡包理机，PHY-Ⅲ型病理组织漂烘仪等系列高新仪器设备。
病理科同时开展常规病理学检查、细胞学检查和术中快速病理诊断技术，并积极开展科研工作。
近年业务工作量，活检4000例以上，细胞学检查在5000余例，病理切片质量较高。