南京市中西医结合医院麻醉科是集医疗、教学、科研为一体的二级临床学科。科室配有高标准手术间10间、麻醉复苏室床位3张。

目前共有医护人员34人，其中麻醉医生12人（高级职称6人、中级职称6人），麻醉护士4人，手术室护士18人。科室配备脑氧监测仪、电子纤维支气管镜、可视喉镜、血气分析仪、血液回收机、便携式超声、加温仪等先进医疗设备。各手术间均配有高端麻醉机、多功能监护仪，高清腔镜系统等。

科室工作范畴涵盖临床麻醉、疼痛诊疗、舒适化医疗（无痛消化内镜、无痛计划生育手术、无痛分娩、无痛纤支镜、镇静镇痛下的检查）及麻醉治疗学（难治性失眠的诊治等）等。科室累计发表SCI、核心期刊等30余篇，主持江苏省和南京市医学发展基金资助课题三项。

百级层流手术室是采用空气洁净技术对微生物污染采取程度不同的控制，以达到控制空间环境中空气洁净度适于各类手术之要求；并提供适宜的温、湿度，创造一个清新、洁净、舒适、细菌数低的手术空间环境，使患者在手术时组织受到尽可能少的损伤，减低感染率，尤其是颅内手术和烧伤手术，患者术后能更快更好地恢复。百级层流手术室可提供舒适的气流，室内温度可控制在22℃~26℃，湿度可控制在40%~60%之间，手术室内空气清新、爽洁，环境舒适；层流手术室是正压气流(对等级低且相邻的洁净区域压力为+10-15Pa)，可以防止外来污染物的进入，降低了院内感染率，尤其是降低了手术切口的感染率。